A partir do sexto ano do Ensino Fundamental , há o desenvolvimento integral dos educandos, proporcionando condições pedagógicas adequadas para aprendizagem por meio de relações saudáveis e atendimento personalizado. Nesse nível de ensino dá-se ênfase à necessidade dos alunos se organizarem e aprimorarem a autonomia na realização de tarefas e participação de atividades específicas organizadas pelo Colégio, tais como feiras, trabalhos, entre outros.
No primeiro ano do Ensino Fundamental II (6º Ano), em consonância com o objetivo geral do Colégio, visamos à integração dos alunos recém-saídos do Ensino Fundamental I ao novo tipo de trabalho pedagógico: a pluridocência. Desse modo, os alunos são inseridos no mundo das áreas do conhecimento e suas respectivas disciplinas, de modo que possam se desenvolver com organização e maior consciência de seu processo formativo.